מֵידָע

A4. המשך המחייב - ביולוגיה

A4. המשך המחייב - ביולוגיה


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

זיקות כריכה נותנות לנו דרך למדוד את החוזק היחסי של הקישור בין שני חומרים. אבל עד כמה "הדוק" מחייב הדוק? כריכה חלשה? הבה נבחן סוגיה זו על ידי בחינת רצף מחייב. שקול שני חומרים, (A ) ו- (B ) שיכולים ליצור אינטראקציה. באיזה טווח של חוזקות הם יכולים למעשה להיקשר זה לזה? זה יעזור להגדיר את הקצוות של הרצף המחייב. בקצה אחד אינו מחייב כלל. בקצה השני, שקול שני דברים שנקשרים באופן קוולנטי. דנו כיצד (K_d) משקף חוזק מחייב. זכור,

[K_d = dfrac {1} {K_ {eq}}. ]

כמו כן, אנו יודעים ש (K_ {eq} ) קשורה ל- (ΔG^o ), על ידי המשוואות:

[ Delta G^o = - RT ln K_ {eq} = RT ln K_d ]

בהינתן המשוואות הפשוטות הללו, אתה אמור להיות מסוגל להמיר בין (K_{eq}), (K_d) ו-(ΔG^o). (שמור על יחידות ישרות.).

אין אינטראקציה

קצה אחד של הרצף המחייב אינו מייצג אינטראקציה. נניח ש (K_ {eq} ) הוא זעיר (Kd גדול), למשל (K_ {eq} ~ 2.4 10-72 0. חיבור זה למשוואה

[ Delta , G^o = -RT , ln K_ {eq} ]

כאשר R = 2.00 cal/mol.K, ו-T הוא בערך 300K, ה- ΔGo ~ +100 קק"ל/מול. כלומר, אם נוסיף A+B, אין כונן ליצירת AB. אם אכן נוצר AB, הוא היה מתפרק מיד.

אינטראקציה קוולנטית

בקצה השני של הרצף שקול את האינטראקציה של אטום 1H עם אחר ליצירת H2. מתוך ספר כימיה כללי נוכל לקבל (ΔG^o_ {form} ). שימוש ב- General Chem. תרמודינמיקה, אנו יכולים לחשב (ΔG^o ) ליצירת H-H.

[ΔG^o = sum G^o_ {form} prod. - sum G^o_ {form} מגיבים. ]

פעולה זו נותנת ערך של -97 קק"ל/מול.

קשירה ספציפית ובלתי ספציפית

שקול את האינטראקציה של חלבון, ה מדכא למבדה (R), עם אוליגנוקלאוטיד קטן שאליו הוא נקשר בחוזקה (נקרא ה- DNA המפעיל, O). זוהי דוגמה לאינטראקציה הדוקה ביולוגית אך הפיכה. R יכול להיקשר לאוליגונוקלאוטידים קצרים רבים עקב אינטראקציות אלקטרוסטטיות וקשרי H מהחלבון הטעון חיובי לעמוד השדרה של חומצת הגרעין המטען השלילי. האינטראקציה המחייבת הדוקה, עם זאת, כרוכה באוליגונוקלאוטידים ברצף בסיס ספציפי. מכאן שנוכל להבחין בין כריכה הדוקה, הכוללת בדרך כלל רצף DNA ספציפי לבין כריכה חלשה הכוללת רצפים לא ספציפיים. באופן דומה נדבר על כריכה ספציפית ולא ספציפית. R ו-O, הנקשרים עם Kd של 1 pM, הם דוגמה לקישור ספציפי, בעוד R ו-DNA לא ספציפי (D), הנקשרים בעיקר באמצעות אינטראקציות אלקטרוסטטיות עם Kd של 1 mM, הם דוגמה לקישור לא ספציפי. אתה עשוי לצפות שכל חלבון טעון חיובי, כמו ציטוכרום C מיטוכונדריאלי, יקשר DNA בעל מטען שלילי. לאינטראקציה הלא ספציפית הזו לא תהיה משמעות ביולוגית מכיוון ששניהם ממוקמים בתאים שונים בתא. לעומת זאת, האינטראקציה בין חלבוני היסטון בעלי מטען חיובי, הקשורים ל-DNA בגרעין, תהיה ספציפית.

קבוע תעריפי איגוד והתאגדות

כאשר התגובה (M + L rightlefth כפיות ML ) נמצאת בשיווי משקל, קצב התגובה קדימה שווה לקצב התגובה ההפוכה. מהכימיה הכללית, התגובה קדימה היא ביומולקולרית ומסדר שני. מכאן ש- vf, הקצב בכיוון קדימה פרופורציונלי ל- [M] [L], או (v_f = k_f [M] [L] ), כאשר kf הוא קבוע הקצב בכיוון קדימה. קצב התגובה ההפוכה, vr הוא מסדר ראשון, פרופורציונלי ל-[ML], וניתן על ידי (v_r = k_r [ML]), כאשר kr הוא קבוע הקצב של התגובה ההפוכה. שימו לב כי יחידות ה- kf הן M-1s-1, ואילו יחידות ה- kr הן s-1. בשיווי משקל, (v_f = v_r ), או (k_f [M] [L] = k_r [ML] ). סידור מחדש של המשוואה נותן

[ dfrac {[ML]} {[M] [L]} = dfrac {k_f} {k_r} = K_ {eq}. ]

מכאן ש (K_ {eq} ) ניתן ביחס בין קבועי התעריפים. לאינטראקציות מחייבות הדוקות, Keq >> 1, Kd << 1 ו- kf גדול מאוד (בסדר גודל של 108-9) וה- kr חייב להיות קטן מאוד (10-2-10 -4 s-1).

כדי לקבל הבנה אינטואיטיבית יותר של ה- Kd, לרוב קל יותר לחשוב על קבועי הקצב התורמים לקשירה ולדיסוציאציה. נניח כי kr הוא קבוע התעריפים המתאר את תגובת הדיסוציאציה. פעמים רבות קוראים לזה קוף. ניתן להראות מתמטית שהקצב שבו שני אובייקטים פשוטים מתחברים תלוי ברדיוס ובמשקל המולקולרי האפקטיבי שלהם. הקצב המקסימלי שבו הם יתקשרו הוא הקצב המקסימלי שבו הדיפוזיה תוביל אותם יחד. נניח כי קצב ההתקשרות של M ו- L מוגבל בדיפוזיה. הקון התיאורטי הוא כ 108 M-1s-1. בידיעה זו, ה-Kd והעובדה ש-(dfrac{k_{on}}{k_{off}} = K_{eq} = dfrac{1}{K_d}), נוכל לחשב קוף, אשר לזכור הוא קבוע שיעור הזמנה ראשונה ..

אנחנו יכולים גם לקבוע k off בניסוי. תארו לעצמכם את הדוגמה הבאה. התאם את הריכוזים של M ו-L כך ש-Mo << Lo and Lo>> Kd. בתנאים אלה של עודף ליגנד, M נמצא לחלוטין ב-bound from, ML. כעת ב-t = 0, דלל את התמיסה כך ש-(L_o ll K_d). התהליך היחיד שיתרחש כאן הוא דיסוציאציה, שכן אסוציאציה זניחה יכולה להתרחש בהינתן המצב החדש. אם אתה יכול למדוד את הפעילות הביולוגית של ML, אז אתה יכול למדוד את קצב ההיעלמות של ML עם הזמן, ולקבל קוף. לחלופין, אם היית יכול למדוד את הפעילות הביולוגית של M, הקצב שבו הפעילות חוזרת ייתן לך (k_ {off} ).

כעת תזכרו מהכימיה הכללית שמקבוע קצב מסדר ראשון, ניתן לחשב את זמן מחצית החיים של התגובה על ידי הביטוי: (k = dfrac{0.693}{t_{1/2}}). מכאן שניתן קופ, ניתן לקבוע את t1/2 לקיום המינים הקשורים. כלומר, כמה זמן יימשך קומפלקס של ML לפני שהוא מתנתק? בהינתן Δ< face="Arial">Go< face="Arial"> או Kd, ובהנחה של kon (108 M-1s-1 ), אתה אמור להיות מסוגל לחשב koff ו-t1/2. לחלופין, תוכל לקבוע את הניסוי בקופס ולאחר מכן לחשב את t1/2. יישום עקרונות אלה, תוכל לחשב את הפרמטרים שלהלן.

מחשב קופ ו t1/2 עבור מתחמים בינאאריים בהנחה שדון מבוקר דיפוזיה
מורכבKD (M)קכבוי-1)t ½
H21 x 10-711 x 10-632 x 1055 שנה
RtV3: Rt'L3 (א)10-171 x 10-9שנתיים
אבידין: ביוטין10-151 x 10-780 יום
טרומבין: הירודין (ב)5 x10-145 x 10-62 ימים
lacrep: DNAoper (ג)1 x 10-131 x 10-50.8 ימים
Zif268: DNA (ד)10-111 x 10-3700 שניות
GroEL: r-lactalbumin (e)10-90.17 ש'
TBP: TATA (f)2 x 10-92 x 10-13 שניות
TBP: TBP4 x 10-94 x 10-12 שניות
LDH (חזיר): NADH (g)7.1 x 10-7(י)7.1 x 10110 אלפיות השנייה
פרופילן: CaATP-G-actin1.2 x 10-61.2 x 1026 אלפיות השנייה
TBP: DNA לא ספציפי (h)5 x 10-65 x 1021 MS
TCR(i): פפטיד ציטו C7X10-57X103100 אותנו
lacrep: DNAnonspec (h)1 x 10-41 X10470 אותנו
uridine-3P: RNase1.4 x 10-4 (י)1.4X10-450 אנחנו
קריאטין קינאז: ADP8.2 x 10-4 (י)8.2X10410 אותנו
אצטילכולין: אסטראז1.2 x 10-31.2 x 1056 אנחנו
ללא אינטראקציה4 x 10734 x 1081-
  1. Trivalent Vancomycin נגזרת RtV3 + Trivalent D-Ala-D-Ala נגזרת, Rt'L3'
  2. Hirudin הוא מעכב תרומבין חזק מרוק שטיפה
  3. lac rep הוא חלבון ה-E. Coli lac operon repressor, ו-DNAoper הוא אזור הקישור הספציפי של ה-DNA בגנום E. Coli שנקשר ל-Repressor
  4. Zif268 הוא חלבון מחייב עכבר לאצבע
  5. GroEL הוא חלבון מלווה; r-lactalbumin היא הצורה המופחתת של lactalbumin
  6. TBP הוא החלבון המחייב TATA אשר נקשר לרצף הקונצנזוס של תיבת TATA
  7. LDH הוא לקטט דהידרוגנאז
  8. DNAnonspec הוא DNA שאינו מכיל את אזור רצף ה- DNA הספציפי המעורב בספציפי
    קשירה לחלבון קושר DNA
  9. TCR הוא הקולטן לתאי T
  10. מחושב מתוך משוואה: KD = koff/kon.

מה שנמדד בדרך כלל הוא Kd ו/או קופ (אם הקופ סביר). ניתוח זה פשוט מאוד. כוחות אלקטרוסטטיים וגורמי התמצאות אחרים עשויים להשתנות באופן משמעותי, בעוד ששינויים קונפורמטיביים במכלול עשויים למנוע התנתקות מוכנה של הליגנד המאוגד, ושינוי דרמטי של הקופ.

המבנה של אחד ממתחמי הקשירה ההדוקים ביותר, אבידין וביוטין, מוצג להלן.

Jmol: מעודכן Avidin:Biotin Complex (1AVD) Jmol14 (Java) | JSMol (HTML5)

חשוב לציין שגם תגובות המאופיינות ב-Kd גבוה יכולות להיות ספציפיות. הספציפיות מוגדרת בסופו של דבר כאינטראקציה מחייבת בין מקרו-מולקולה וליגנד הניתנת לשיתוף מקומי באותה סביבה ואשר עבורה מפותחת פונקציה ביולוגית עם כריכה.


חלבון עמילואיד בטא A4

<p>ציון ההערה מספק מדד היוריסטי של תוכן ההערות של ערך UniProtKB או פרוטום. ניקוד זה אינו יכול לשמש כמדד לדיוק ההערה מכיוון שאיננו יכולים להגדיר את ההערה הנכונה עבור כל חלבון נתון. & Ltp> & lta href = '/help/annotation_score' target = '_ top'> יותר. & lt/a> & lt/p> - עדויות ניסיוניות ברמת תעתיק i & ltp> זה מצביע על סוג הראיות התומכות בקיומו של החלבון. שים לב כי עדויות 'קיום החלבון' אינן נותנות מידע על הדיוק או הנכונות של הרצפים המוצגים. & Ltp> & lta href = '/help/protein_existence' target = '_ top'> עוד. & lt/a> & lt/p>

בחר קטע משמאל כדי לראות תוכן.


תוכן

אינטגרינים הם הטרודימרים חובה המורכבים מתת-יחידות α ו-β. מספר גנים מקודדים לאיזופורמים מרובים של תת-יחידות אלו, מה שיוצר מערך של אינטגרינים ייחודיים עם פעילות מגוונת. אצל יונקים האינטרינים מורכבים משמונה עשר יחידות משנה α ושמונה β, [5] ב תסיסנית חמש α ושתי יחידות משנה β, וב Caenorhabditis נמטודות שתי תת-יחידות α ותת-יחידת β אחת. [6] יחידות המשנה α ו- β הן חלבונים טרנסממברניים מסוג I, כך שכל אחת חודרת פעם אחת לקרום הפלזמה ויכולה להחזיק במספר תחומים ציטופלסמיים. [7]

גרסאות של יחידות משנה מסוימות נוצרות על ידי שחבור RNA דיפרנציאלי למשל, ארבע גרסאות של יחידת המשנה בטא 1 קיימות. באמצעות שילובים שונים של יחידות המשנה α ו- β, נוצרים 24 אינטגרינים ייחודיים ליונקים, למעט וריאנטים של שחבורות וגליקוזילציה. [8]

יחידות משנה של אינטגרין משתרעות על קרום התא ויש להן תחומים ציטופלסמיים קצרים של 40-70 חומצות אמינו. היוצא מן הכלל הוא יחידת המשנה בטא 4, בעלת תחום ציטופלסמי של 1,088 חומצות אמינו, אחת הגדולות מכל חלבון ממברנה. מחוץ לממברנת התא, שרשראות α ו- β שוכנות צמודות זו לזו לאורך של כ-23 ננומטר. ה-5 ננומטר הסופי של N-termini של כל שרשרת יוצר אזור קושר ליגנד עבור ה-ECM. הם הושוו לטפרי לובסטר, למרות שהם לא ממש "צובטים" את הליגנד שלהם, הם מתקשרים איתו באופן כימי בחלק הפנימי של "העצות" של "הצביטות" שלהם.

המסה המולקולרית של יחידות המשנה של האינטגרין יכולה לנוע בין 90 kDa ל- 160 kDa. יחידות משנה של בטא כוללות ארבע רצפים חוזרים ועשירים בציסטאין. שתי יחידות המשנה α ו- β קושרות מספר קטיונים דו -ערכיים. תפקידם של קטיונים דו -ערכיים ביחידת המשנה α אינו ידוע, אך עשוי לייצב את קפלי החלבון. הקטיונים בתת-יחידות ה-β מעניינים יותר: הם מעורבים ישירות בתיאום לפחות חלק מהליגנדים שקושרים אינטגרינים.

ניתן לסווג אינטגרינים במספר דרכים. לדוגמה, בכמה שרשראות α יש אלמנט מבני נוסף (או "תחום") מוכנס לכיוון מסוף ה- N, תחום alpha-A (נקרא כך מכיוון שיש לו מבנה דומה לתחומי A המצויים בגורם החלבון פון ווילברנד. הוא נקרא גם תחום α-I). אינטגרינים הנושאים תחום זה או נקשרים לקולגנים (למשל אינטגרינים α1 β1, ו- α2 β1), או פועלים כמולקולות הדבקה של תא-תא (אינטגרינים ממשפחת β2). תחום α-I זה הוא אתר הקישור לליגנדים של אינטגרינים כאלה. לאותם אינטגרינים שאינם נושאים את התחום המוכנס הזה יש גם תחום A באתר הקישור לליגנד שלהם, אבל זֶה A-domain נמצא על תת-היחידה β.

בשני המקרים, תחומי A נושאים עד שלושה אתרי קישור קטיונים דו-ערך. האחד תפוס לצמיתות בריכוזים פיזיולוגיים של קטיונים דו -ערכיים, ונושא או סידן או מגנזיום יון, הקטיונים המשותפים העיקריים בדם בריכוזים חציוניים של 1.4 מ"מ (סידן) ו -0.8 מ"מ (מגנזיום). שני האתרים האחרים נעשים תפוסים על ידי קטיונים כאשר ליגנדים נקשרים - לפחות עבור אותם ליגנדים הכוללים חומצת אמינו חומצית באתרי האינטראקציה שלהם. חומצת אמינו חומצית מופיעה באתר אינטראקציה של אינטגרינים של חלבוני ECM רבים, למשל כחלק מרצף חומצות האמינו ארגינין-גליצין-אספרטית ("RGD" בקוד חומצת האמינו באות אחת).

עריכת מבנה

למרות שנים רבות של מאמצים, גילוי המבנה ברזולוציה גבוהה של אינטגרינים התגלה כמאתגר, שכן חלבונים ממברניים קשים לטיהור קלאסי, וכפי שאינטגרינים גדולים, מורכבים וקשורים לעצי סוכר רבים ("בעלי רמת גליקוזה רבה"). תמונות ברזולוציה נמוכה של תמציות חומרי ניקוי של אינטגרין שלם GPIIbIIIa, שהושגו באמצעות מיקרוסקופ אלקטרונים, ואפילו נתונים מטכניקות עקיפות החוקרות את מאפייני הפתרון של אינטגרינים באמצעות אולטרא-צנטריפוגה ופיזור אור, שולבו עם נתוני קריסטלוגרפיקה או NMR ברזולוציה גבוהה או NMR מנתונים בודדים או תחומים משויכים של שרשרות אינטגרין בודדות, ומודלים מולקולריים המונחים עבור שאר השרשראות.

מבנה קריסטל הרנטגן המתקבל עבור האזור החוץ-תאי השלם של אינטגרין אחד, αvβ3, [1] מראה את המולקולה המתקפלת לצורת V הפוכה שעלולה להביא את האתרים המחייבים ליגנד קרוב לקרום התא. אולי חשוב מכך, מבנה הגביש התקבל גם עבור אותו האינטרין הקשור ליגנד קטן המכיל את רצף ה- RGD, התרופה cilengitide. [9] כמפורט לעיל, הדבר גילה לבסוף מדוע קטיונים דו-ערכיים (בתחומי A) הם קריטיים לקשירת ליגנד RGD לאינטגרינים. האינטראקציה של רצפים כאלה עם אינטגרינים נחשבת כמתג עיקרי שבאמצעותו ECM מפעיל את השפעותיו על התנהגות התא.

המבנה מעלה שאלות רבות, במיוחד בנוגע לקשירת ליגנד והתמרת אותות. אתר הקישור של הליגנד מופנה לכיוון מסוף ה-C של האינטגרין, האזור שבו המולקולה יוצאת מקרום התא. אם הוא יוצא אורתוגונלית מהקרום, ככל הנראה אתר הקישור של הליגנד ייחסם, במיוחד מאחר וליגנדים אינטגרינים הם בדרך כלל רכיבים מאסיביים וצולבים היטב של ה- ECM. למעשה, מעט מאוד ידוע על הזווית שחלבוני הממברנה מכניסים למישור הממברנה וזו בעיה שקשה לטפל בה בעזרת טכנולוגיות זמינות. הנחת ברירת המחדל היא שהם מופיעים כמו סוכריות על מקל קטנות, אך הראיות להשערה מתוקה זו ניכרות בהיעדרה. מבנה האינטגרין משך את תשומת הלב לבעיה זו, שעלולה להיות לה השלכות כלליות על אופן הפעולה של חלבוני הממברנה. נראה שהסלילים הטרנסממברניים של האינטגרין מוטים (ראה "הפעלה" להלן), מה שרומז שגם השרשראות החוץ-תאיות אינן אורתוגונליות ביחס למשטח הממברנה.

למרות שמבנה הקריסטל השתנה מעט באופן מפתיע לאחר הקישור לצילנגיטיד, ההשערה הנוכחית היא שתפקוד האינטגרין כרוך בשינויי צורה כדי להעביר את אתר קשירת הליגנד למיקום נגיש יותר, הרחק מפני התא, ושינוי צורה זה מעורר גם איתות תאיים. . ישנו גוף רחב של ספרות תא ביולוגית וביוכימית התומכת בהשקפה זו. אולי העדות המשכנעת ביותר כוללת שימוש בנוגדנים המזהים אינטגרינים רק כאשר הם נקשרו לליגנדים שלהם, או מופעלים. מכיוון ש"טביעת הרגל" שעושה נוגדן על יעד הקישור שלו היא בערך מעגל בקוטר של כ-3 ננומטר, הרזולוציה של טכניקה זו נמוכה. עם זאת, הנוגדנים הנקראים LIBS (Ligand-Induced-Binding-Sites) מראים באופן חד משמעי ששינויים דרמטיים בצורת האינטגרין מתרחשים באופן שגרתי. עם זאת, איך השינויים שזוהו עם נוגדנים נראים על המבנה עדיין לא ידוע.

עריכת הפעלה

כאשר משתחררים לממברנת התא, משערים שדימרי אינטגרין שסונתזו לאחרונה נמצאים באותה מבנה "כפוף" המתגלה על ידי המחקרים המבניים שתוארו לעיל. אסכולה אחת טוענת כי צורה כפופה זו מונעת מהם אינטראקציה עם הליגנדים שלהם, אם כי צורות כפופות יכולות לשלוט במבני EM ברזולוציה גבוהה של אינטגרין הקשור ליגנד ECM. לכן, לפחות בניסויים ביוכימיים, דימרים של אינטגרין חייבים כנראה שלא להיות 'בלתי כפופים' כדי לקדם אותם ולאפשר את הקישור שלהם ל-ECM. בתאים, ההתחלה מתבצעת על ידי טלין חלבון, הנקשר לזנב β של דימר האינטגרין ומשנה את הקונפורמציה שלו. [10] [11] שרשראות האינטגרין α ו-β הן חלבונים טרנסממברניים מסוג I: הם עוברים את קרום הפלזמה כסלילי אלפא טרנסממברניים בודדים. למרבה הצער, הסלילים ארוכים מדי, ומחקרים עדכניים מראים כי עבור integrin gpIIbIIIa, הם מוטים הן ביחס זה לזה והן ביחס למישור הממברנה. כריכת הטאלין משנה את זווית ההטיה של סליל הטרנסממברני של שרשרת β3 במערכות מודלים וזה עשוי לשקף שלב בתהליך האיתות מבפנים החוצה אשר מוביל את האינטגרינים. [12] יתר על כן, חלבוני הטאלין מסוגלים להתעמעם [13] ולכן הם נחשבים כמתערבים בצירוף דימרים של אינטגרין מה שמוביל ליצירת הידבקות מוקדית. לאחרונה נמצאו גם חלבוני Kindlin-1 ו- Kindlin-2 כאינטראקציה עם אינטגרין ומפעילים אותו. [14]

לאינטגרינים יש שתי פונקציות עיקריות, הצמדת התאים ל- ECM והתמרת אותות מה- ECM לתאים. [15] הם גם מעורבים במגוון רחב של פעילויות ביולוגיות אחרות, כולל אקסטרה-ווסציה, הידבקות תא לתא, נדידת תאים וכקולטנים לנגיפים מסוימים, כגון אדנו-וירוס, אקו-וירוס, הנט-וירוס וכף-פה. מחלות, וירוס פוליו ונגיפים אחרים.

תפקיד בולט של האינטגרינים נראה במולקולה GpIIb/IIIa, אינטגרין על פני טסיות הדם (טרומבוציטים) האחראית על ההתקשרות לפיברין בתוך קריש דם מתפתח. מולקולה זו מגדילה באופן דרמטי את זיקה המחייבת שלה לפיברין/פיברינוגן באמצעות קשר של טסיות דם עם קולגנים חשופים באתר הפצע. עם חיבור הטסיות לקולגן, GPIIb/IIIa משנה את צורתו, ומאפשר לה להיקשר לפיברין ולרכיבי דם אחרים כדי ליצור את מטריצת הקריש ולעצור אובדן דם.

חיבור התא לעריכת ECM

אינטגרינים מצמידים את ה- ECM מחוץ לתא לתאי השלד (בפרט המיקרופילמנטים) שבתוך התא. לאיזו ליגנד ב- ECM שהאינטגרין יכול להיקשר מוגדר על פיה מיוצר יחידות המשנה α ו- β שהאינטגרין בנוי ממנה. בין הליגנדים של האינטגרינים ניתן למנות פיברונקטין, ויטרונקין, קולגן ולמינין. החיבור בין התא ל- ECM עשוי לסייע לתא לסבול כוחות משיכה מבלי להינתק מה- ECM. היכולת של תא ליצור קשר מסוג זה היא גם בעלת חשיבות חיונית באונטוגניה.

הצמדת תאים ל- ECM היא דרישה בסיסית לבניית אורגניזם רב תאי. האינטגרינים אינם פשוט קרסים, אלא נותנים לתא אותות קריטיים לגבי אופי סביבתו. יחד עם אותות הנובעים מקולטנים לגורמי גדילה מסיסים כמו VEGF, EGF ורבים אחרים, הם אוכפים החלטה תאית על איזו פעולה ביולוגית לנקוט, בין אם זו התקשרות, תנועה, מוות או בידול. לפיכך האינטגרינים נמצאים בלבם של תהליכים ביולוגיים תאיים רבים. ההתקשרות של התא מתרחשת באמצעות יצירת מתחמי הידבקות תאים, המורכבים מאינטרינים וחלבונים ציטופלסמיים רבים, כגון טלין, וינקולין, פקסילין ואלפא אקטינין. אלה פועלים על ידי ויסות קינאז כגון FAK (focal adhesion kinase) ובני משפחת Src kinase לזרחון מצעים כגון p130CAS ובכך מגייסים מתאמי איתות כגון CRK. מתחמי הידבקות אלו נצמדים לשלד האקטין. האינטגרינים משמשים אפוא לקשר בין שתי רשתות על פני קרום הפלזמה: ה- ECM החוץ -תאי והמערכת נימה האקטין התאי. Integrin α6β4 הוא יוצא מן הכלל: הוא מקשר למערכת נימה הביניים קראטין בתאי אפיתל. [16]

הידבקויות מוקדיות הן קומפלקסים מולקולריים גדולים, שנוצרים בעקבות אינטראקציה של אינטגרינים עם ECM, ולאחר מכן התקבצות שלהם. האשכולות מספקים ככל הנראה אתרי כריכה תאיים מספיקים כדי לאפשר יצירת מתחמי איתות יציבים בצד הציטופלסמי של קרום התא. כך שההדבקות המוקדיות מכילות ליגנד אינטגרין, מולקולת אינטגרין וחלבוני רובד משייכים. הקישור מונע על ידי שינויים באנרגיה החופשית. [17] כאמור, מתחמים אלה מחברים את המטריצה ​​החוץ -תאית לחבילות אקטין. טומוגרפיה קריו-אלקטרונים מגלה שההדבקה מכילה חלקיקים על קרום התא בקוטר של 25 +/- 5 ננומטר ומרווחים בכ -45 ננומטר. [18] טיפול במעכב Rho-kinase Y-27632 מקטין את גודל החלקיק, והוא רגיש ביותר למכנו. [19]

תפקיד חשוב אחד של אינטגרינים בתאים בתרבית רקמות הוא תפקידם בהגירת תאים. תאים נדבקים למצע באמצעות האינטגרינים שלהם. במהלך התנועה, התא יוצר חיבורים חדשים אל המצע בחזיתו ובמקביל משחרר את אלה מאחוריו. כאשר הם משתחררים מהמצע, מולקולות האינטגרין נלקחות בחזרה לתא על ידי אנדוציטוזה והן מועברות דרך התא לקדמתו על ידי המחזור האנדוציטי, שם הן מתווספות בחזרה אל פני השטח. בדרך זו הם ניידים לשימוש חוזר, ומאפשרים לתא ליצור קבצים מצורפים טריים בחזית המובילה שלו. [20] מעגל האנדוציטוזה של האינטגרין ומיחזור חזרה אל פני התא חשוב גם לאי תנועה נודדת ובמהלך התפתחות בעלי חיים. [21]

העברת אותות ערוך

אינטגרינים ממלאים תפקיד חשוב באיתות תאים על ידי אפנון מסלולי האיתות של התא של קינאזות חלבון טרנסממברניות כגון קולטן טירוזין קינאז (RTK). בעוד שהאינטראקציה בין אינטגרין לקולטן טירוזין קינאז נחשבה במקור כחד-כיוונית ותומכת, מחקרים עדכניים מצביעים על כך שלאינטגרינים יש תפקידים נוספים ורב-פנים באיתות התא. אינטגרינים יכולים לווסת את איתות הטירוזין קינאז של הקולטן על ידי גיוס מתאמים ספציפיים לקרום הפלזמה. לדוגמה, β1c integrin מגייס את Gab1/Shp2 ומציג Shp2 ל-IGF1R, וכתוצאה מכך דה-פוספורילציה של הקולטן. [22] בכיוון ההפוך, כאשר מופעל טירוזין קינאז קולטן, אינטגרינים לוקליזציה משותפת בהדבקה מוקדית עם טירוזין קינאזות הקולטן ומולקולות האיתות הקשורות להן.

רפרטואר האינטגרינים המתבטא בתא מסוים יכול לציין את מסלול האיתות בשל הזיקה המחייבת דיפרנציאלית של ליגנדים ECM לאינטגרינים. קשיחות הרקמות והרכב המטריצה ​​יכולים ליזום מסלולי איתות ספציפיים המסדירים את התנהגות התא. אשכול והפעלה של מתחמי האינטגרינים/אקטין מחזקים את האינטראקציה ההדבקה המוקדית ויוזמים את המסגרת לאיתות תאים באמצעות הרכבה של דבקים. [23]

בהתאם להשפעה הרגולטורית של האינטגרין על קינאזות טירוזין קולטן ספציפיות, התא יכול לחוות:

הידע על הקשר בין אינטגרינים לקולטן טירוזין קינאז הניח בסיס לגישות חדשות לטיפול בסרטן. באופן ספציפי, מיקוד לאינטגרינים הקשורים ל-RTKs היא גישה מתפתחת לעיכוב אנגיוגנזה. [25]

לאינטגרינים יש תפקיד חשוב בהתחדשות עצבית לאחר פגיעה במערכת העצבים ההיקפית (PNS). [26] אינטגרינים נמצאים בקונוס הצמיחה של נוירוני PNS פגומים ונצמדים לליגנדים ב-ECM כדי לקדם התחדשות האקסונים. לא ברור אם אינטגרינים יכולים לקדם את התחדשות האקסונים במערכת העצבים המרכזית של מבוגרים (CNS). ישנם שני מכשולים המונעים התחדשות בתיווך אינטגרין במערכת העצבים המרכזית: 1) אינטגרינים אינם ממוקמים באקסון של רוב הנוירונים של מערכת העצבים המרכזית הבוגרים ו-2) אינטגרינים הופכים לא פעילים על ידי מולקולות ברקמת הצלקת לאחר פציעה. [26]

להלן 16 מתוך

24 אינטגרינים שנמצאים בחולייתנים:

שֵׁם מילים נרדפות הפצה ליגנדים
α1β1 VLA-1 רב קולגנים, למינינים [27]
α2β1 VLA-2 רב קולגנים, למינינים [27]
α3β1 VLA-3 רב למינין -5
α4β1 VLA-4 [27] תאים המטופויאטיים פיברונקטין, VCAM-1 [27]
α5β1 קולטן VLA-5 פיברונקטין נָפוֹץ פיברונקטין [27] ופרוטאינזים
α6β1 קולטן למינין VLA-6 נָפוֹץ למינינים
α7β1 שריר, גליומה למינינים
αלβ2 LFA-1 [27] לימפוציטים מסוג T ICAM-1, ICAM-2 [27]
αMβ2 Mac-1, CR3 [27] נויטרופילים ומונוציטים חלבוני סרום, ICAM-1 [27]
αIIbβ3 קולטן פיברינוגן gpIIbIIIa [28] טסיות [27] פיברינוגן, פיברונקטין [27]
αוβ1 גידולים נוירולוגיים ויטרונטין פיברינוגן
αוβ3 קולטן ויטרונקטין [29] תאי אנדותל מופעלים, מלנומה, גליובלסטומה ויטרונקטין, [29] פיברונקטין, פיברינוגן, אוסטאופונטין, Cyr61, תירוקסין, [30] TETRAC
αוβ5 נפוץ, במיוחד. פיברובלסטים, תאי אפיתל ויטרקנטין ואדנווירוס
αוβ6 אפיתליה מתרבים, במיוחד. בלוטת ריאה וחלב fibronectin TGFβ1+3
αוβ8 עצב היקפי של רקמה עצבית fibronectin TGFβ1+3
α6β4 תאי אפיתל [27] למינין [27]

אינטגרנים של בטא 1 מתקשרים עם שרשראות אלפא אינטגרין רבות. נוק-אאוט גנים של אינטגרינים בעכברים אינו תמיד קטלני, מה שמרמז כי במהלך התפתחות העובר, אינטגרין אחד עשוי להחליף את תפקידו באחר על מנת לאפשר הישרדות. חלק מהאינטגרינים נמצאים על פני התא במצב לא פעיל, וניתן לקדם אותם במהירות, או להכניס אותם למצב המסוגל לקשור את הליגנדים שלהם, על ידי ציטוקינים. אינטגרינים יכולים לקבל מספר צורות מוגדרות היטב או "מצבי קונפורמציה". לאחר הפעלה, המצב הקונפורמטיבי משתנה כדי לעורר את קשירת הליגנד, אשר מפעיל אז את הקולטנים-גם על ידי גרימת שינוי צורה-כדי לעורר את התמרת האות מבחוץ.


תכונות תרמודינמיות של לוקוטריאן A 4 מעכבי הידרולאז

הלוקוטריאן א4 הידרולאז (LTA4H) הוא אנזים דו -פונקציונלי, המכיל פפטידאז ופעילות הידרוליזה לשתי הפעילויות בעלות פונקציות מנוגדות המסדירות תגובה דלקתית. פעילות ההידרולאז אחראית להמרה של לוקוטריאן A.4 ללוקוטריין B פרו-דלקתי4ומכאן שמעכבים סלקטיביים של פעילות ההידרולאז הם בעלי עניין תרופתי גבוה. כאן אנו מציגים את האפיון התרמודינמי של מעכבים מובנים מבחינה מבנית של ה- LTA4H שתופסים אזורים שונים של האתר המחייב באמצעות שיטות ביופיסיות שונות. שיטת in silico לקביעת מולקולות מים מיוצבות באתר המחייב של מבנה ה- apo של LTA4H משמש לפרש את הנתונים התרמודינמיים הנמדדים וסיפק תובנות לעיצוב LTA חדש4מעכבי H.

מילות מפתח: מבנה Apo LTA (4) H Ligand מחייב מיפוי מים.


פיתוח מעכבים סלקטיביים הדבקים ללוקוטרין A4 הידרוליז

תצוגות מאמרים הן הסכום התואם COUNTER של הורדות מאמרים בטקסט מלא מאז נובמבר 2008 (הן PDF והן HTML) בכל המוסדות והיחידים. מדדים אלה מתעדכנים באופן קבוע על מנת לשקף את השימוש עד לימים האחרונים.

ציטוטים הם מספר המאמרים האחרים המצטטים מאמר זה, מחושב לפי Crossref ומתעדכן מדי יום. מצא מידע נוסף אודות ספירות ציטוט של מחברים.

ציון הקשב האלטמטרי הוא מדד כמותי לתשומת הלב שמאמר מחקר קיבל באינטרנט. לחיצה על סמל הסופגניות תטען דף באתר altmetric.com עם פרטים נוספים אודות הציון ונוכחות המדיה החברתית עבור המאמר הנתון. מצא מידע נוסף על ציון תשומת הלב האלטמטרי וכיצד מחושב הציון.

הערה: במקום תקציר, זהו העמוד הראשון של המאמר.


מבני קריסטל ברזולוציה גבוהה של תחומי איגוד Clostridium botulinum neurotoxin A3 ו- A4

נוירוטוקסינים של Clostridium botulinum (BoNTs) גורמים למצב מסכן חיים, בוטוליזם. עם זאת, בעוד שיש להם פוטנציאל לגרום לנזק חמור, הם מנוצלים יותר ויותר ליישומים טיפוליים. BoNTs מורכבים משבעה סרוטיפים נפרדים המכונים BoNT/A עד BoNT/G, כאשר המאפיין הנרחב ביותר הוא תת-סרוטיפ BoNT/A1. כל BoNT מורכב משלושה תחומים שונים מבחינה מבנית, תחום מחייב (Hג), תחום טרנסלוקציה (Hנ), ותחום פרוטאוליטי (LC). הג התחום אחראי למיקוד הספציפי ביותר של הנוירוטוקסין לממברנות תאי עצב. כאן, אנו מציגים שני מבנים ברזולוציה גבוהה של התחום המחייב של תת-סוג BoNT/A3 (Hג/A3) ו-BoNT/A4 (Hג/A4) ברזולוציה של 1.6 Å ו -1.34 Å, בהתאמה. המבנים של שני החלבונים חולקים רמה גבוהה של דמיון ל- BoNT H ידוע אחרג תוך שהם מכילים כמה הבדלים עדינים, והם מועילים לחקר נוירוטוקסינים טיפוליים בעלי מאפיינים חדשים.

מילות מפתח: מבנה תחום מחייב בוטולינום נוירוטוקסין Clostridium botulinum תת -סוגי קריסטלוגרפיה.


& ltp> חלק זה מספק מידע שימושי על החלבון, בעיקר ביולוגיה. & ltp> & lta href = '/help/function_section' target = '_ top'> עוד. & lt/a> & lt/p> פונקציה i

מתפקד כקולטן למשטח התא ומבצע פונקציות פיזיולוגיות על פני השטח של נוירונים הרלוונטיים לצמיחת נויריט, הידבקות עצבית ואקסונוגנזה. אינטראקציה בין מולקולות APP על תאים שכנים מקדמת סינפטוגנזה. מעורב בניידות תאים ובוויסות שעתוק באמצעות אינטראקציות בין חלבון לחלבון (לפי דמיון).

יכול לקדם הפעלת שעתוק באמצעות קישור ל-APBB1-KAT5 ולעכב איתות Notch באמצעות אינטראקציה עם Numb (על ידי דמיון).

זוגות למסלולים מעוררי אפופטוזיס כגון אלה בתיווך G (O) ו- JIP. מעכב פעילות G (o) אלפא ATPase. פועל כקולטן ממברנה קינזין I, המתווך את ההובלה האקסונלית של בטא-סיקרטאז ופרסנילין 1 (לפי דמיון).

על ידי מתנהג כקולטן ממברנה קינזין I, ממלא תפקיד בהובלת האנטרוגרודה האקסונלית של מטען לכיוון סינפסות באקסונים (לפי דמיון).

עשוי להיות מעורב בהומאוסטזיס נחושת/לחץ חמצוני באמצעות הפחתת יוני נחושת. יכול לווסת את צמיחת הנויריט באמצעות קישור לרכיבים של המטריצה ​​החוץ -תאית כגון הפרין וקולגן I ו- IV (לפי דמיון).

לאיזופורמים של splice המכילים את תחום ה-BPTI יש פעילות מעכבת פרוטאז. גורם למסלול תלוי AGER הכולל הפעלה של p38 MAPK, וכתוצאה מכך הפנמה של עמילואיד בטא פפטיד ומובילה לתפקוד מיטוכונדריאלי בתפקוד המיטוכונדריאלי בתרבית בנוירונים בקליפת המוח. מספק יוני Cu 2+ עבור GPC1 אשר נדרשים לשחרור תחמוצת החנקן (NO) והשפלה שלאחר מכן של שרשראות ההפארן סולפט ב-GPC1 (על פי דמיון).

& ltp> מידע שנאסף באופן ידני שהופץ מחלבון קשור המאופיין בניסוי. & lt/p> & ltp> & lta href = "/manual/evidences#ECO: 0000250"> עוד. & lt/a> & lt/p> קביעה ידנית הנובעת מדמיון רצף ל- i

פפטידים עמילואיד-ביתא הם chelators מתכות ליפופיליים עם פעילות מפחיתה מתכות. קושר מתכות חולפות כמו נחושת, אבץ וברזל. פפטידים עמילואיד-ביתא של חולדה ועכבר קושרים רק מתכות חולפות בצורה חלשה ויש להם פעילות מפחיתה מעט עקב החלפות של שאריות קלאטיות מתכות חולפות. חלבון עמילואיד-ביתא 42 עשוי להפעיל פגוציטים חד-גרעיניים במוח ומעורר תגובות דלקתיות. מקדם הן צבירת טאו והן זרחון בתיווך TPK II. קושר גם את GPC1 ברפסודות שומנים (לפי דמיון).

האפיקנים מעוררים הידבקות של תאים עצביים למטריצה ​​החוץ -תאית ועשויים להסדיר את התפתחות הנויריט במוח.

הפפטידים של גמא-CTF כמו גם הפפטידים המפוצלים בקספאז, כולל C31, הם משפרים חזקים של אפופטוזיס עצבי.

N-APP קושר את TNFRSF21 המעורר הפעלה וניוון של קספסות של שני גופי תאים עצביים (דרך קספס-3) ואקסונים (דרך קספס-6).

שונות

קביעה ידנית נגזרת מדמיון רצף ל-i

אתרים

מפתח תכונהתפקידיםתיאור פעולות תצוגה גרפיתאורך
& ltp> סעיף קטן זה של הסעיף & lta href = "http://www.uniprot.org/help/function%5Fsection"> Function & lt/a> מציין באיזה מיקום החלבון קושר יון מתכת נתון. אופי המתכת מצוין בשדה 'תיאור'. & Ltp> & lta href = '/help/metal' target = '_ top'> עוד. & lt/a> & lt/p> כריכת מתכת i 147 Cu (2+) 1 ביאור PROSITE-ProRule

& ltp> מידע מאומת ידני שנוצר על ידי מערכת הביאורים האוטומטיים של UniProtKB. & lt/p> & ltp> & lta href = "/manual/evidences#ECO: 0000255"> עוד. </a></p> קביעה ידנית על פי כללים i


אפיון של H סוג 1 וסוג 1 נ-אפטילקטוזאמין גליקאן אפיטופים על סרטן השחלות המזוהה במיוחד על ידי נוגדן חד-שבטי אנטי-גליקני mAb-A4

גליקנים ספציפיים לסרטן של סרטן השחלות הם אפיטופים מבטיחים למיקוד עם נוגדנים חד שבטיים (mAb). למרות הפוטנציאל שלהם, האפיון המבני של האפיטופים הגליקניים הללו נשאר אתגר משמעותי בהתפתחות הפרה -קלינית של mAb. הקבוצה שלנו יצרה את הנוגדן החד-שבטי mAb-A4 נגד תאי גזע עובריים אנושיים (hESC), שגם נקשרו במיוחד נ-גליקנים קיימים ב -11 מתוך 19 סרטן השחלות (OC) ו -8 מתוך 14 שורות תאי סרטן השד שנבדקו. קווי תאים ורקמות תקינים לא היו מוכתמים על ידי mAb-A4. לאפיין את נ-אפיטופים גליקאן מקושרים על קווי תאים OC ממוקדים על ידי mAb-A4, השתמשנו בגליקוזידאזים, מיקרו-מערך גליקאן, siRNA ורמת מתקדמות בסיוע מטריקס בסיוע לייזר/ספקטרומטריית מסה (MALDI-MS). נמצאו האפיטופים mAb-A4 שהם Fucα1-2Galβ1-3GlcNAcβ (H סוג 1) ו- Galβ1-3GlcNAcβ (סוג 1 LacNAc). מבנים אלו נמצאו על מספר חלבונים מ-hESC ו-OC. Importantly, endo-β-galactosidase coupled with MALDI-MS allowed these two epitopes, for the first time, to be directly identified on the polylactosamines of נ-glycans of SKOV3, IGROV1, OV90, and OVCA433. Furthermore, siRNA knockdown of B3GALT5 expression in SKOV3 demonstrated that mAb-A4 binding was dependent on B3GALT5, providing orthogonal evidence of the epitopes' structures. The recognition of oncofetal H type 1 and type 1 LacNAc on OC by mAb-A4 is a novel and promising way to target OC and supports the theory that cancer can acquire stem-like phenotypes. We propose that the orthogonal framework used in this work could be the basis for advancing anti-glycan mAb characterization.

מילות מפתח: cancer biology cancer therapy embryonic stem cell glycobiology glycoconjugate glycomics mass spectrometry (MS) monoclonal antibody ovarian cancer small interfering RNA (siRNA).

© 2017 by The American Society for Biochemistry and Molecular Biology, Inc.

הצהרת ניגוד אינטרסים

The authors declare that they have no conflicts of interest with the contents of this article


A4. The Binding Continuum - Biology

תמונת מצב נתונים ניסיוני

  • שיטה: הפצת רנטגן
  • רזולוציה: & nbsp3.00 Å
  • ערך R חינם: & nbsp0.270 
  • עבודה R-Value: & nbsp0.253 
  • ערך R נצפה: & nbsp0.255 

אימות wwPDB   דו"ח תלת -ממדי ודוח מלא

Human glutathione transferase A4-4 crystal structures and mutagenesis reveal the basis of high catalytic efficiency with toxic lipid peroxidation products

(1999) J Mol Biol 288: 427-439

  • PubMed: 10329152  Search on PubMed
  • DOI: 10.1006/jmbi.1999.2697
  • ציטוט ראשי של מבנים קשורים:  
    1GUM, 1GUL
  • PubMed תקציר: 

The oxidation of lipids and cell membranes generates cytotoxic compounds implicated in the etiology of aging, cancer, atherosclerosis, neurodegenerative diseases, and other illnesses. Glutathione transferase (GST) A4-4 is a key component in the defense against the products of this oxidative stress because, unlike other Alpha class GSTs, GST A4-4 shows high catalytic activity with lipid peroxidation products such as 4-hydroxynon-2-enal (HNE) .

The oxidation of lipids and cell membranes generates cytotoxic compounds implicated in the etiology of aging, cancer, atherosclerosis, neurodegenerative diseases, and other illnesses. Glutathione transferase (GST) A4-4 is a key component in the defense against the products of this oxidative stress because, unlike other Alpha class GSTs, GST A4-4 shows high catalytic activity with lipid peroxidation products such as 4-hydroxynon-2-enal (HNE). The crystal structure of human apo GST A4-4 unexpectedly possesses an ordered C-terminal alpha-helix, despite the absence of any ligand. The structure of human GST A4-4 in complex with the inhibitor S-(2-iodobenzyl) glutathione reveals key features of the electrophilic substrate-binding pocket which confer specificity toward HNE. Three structural modules form the binding site for electrophilic substrates and thereby govern substrate selectivity: the beta1-alpha1 loop, the end of the alpha4 helix, and the C-terminal alpha9 helix. A few residue changes in GST A4-4 result in alpha9 taking over a predominant role in ligand specificity from the N-terminal loop region important for GST A1-1. Thus, the C-terminal helix alpha9 in GST A4-4 provides pre-existing ligand complementarity rather than acting as a flexible cap as observed in other GST structures. Hydrophobic residues in the alpha9 helix, differing from those in the closely related GST A1-1, delineate a hydrophobic specificity canyon for the binding of lipid peroxidation products. The role of residue Tyr212 as a key catalytic residue, suggested by the crystal structure of the inhibitor complex, is confirmed by mutagenesis results. Tyr212 is positioned to interact with the aldehyde group of the substrate and polarize it for reaction. Tyr212 also coopts part of the binding cleft ordinarily formed by the N-terminal substrate recognition region in the homologous enzyme GST A1-1 to reveal an evolutionary swapping of function between different recognition elements. A structural model of catalysis is presented based on these results.

  • Human Glutathione Transferase A4-4: An Alpha Class Enzyme with High Catalytic Efficiency in the Conjugation of 4-Hydroxynonenal and Other Genotoxic Products of Lipid Peroxidation
    Hubatsch, I., Ridderstrom, M., Mannervik, B.
    (1998) Biochem J 330: 175

Department of Molecular Biology MB4, Skaggs Institute for Chemical Biology, The Scripps Research Institute, 10550 N. Torrey Pines Road, La Jolla, CA, 92037, USA.


<p>This section displays by default the canonical protein sequence and upon request all isoforms described in the entry. It also includes information pertinent to the sequence(s), including <a href="http://www.uniprot.org/help/sequence%5Flength">length</a> and <a href="http://www.uniprot.org/help/sequences">molecular weight</a>. The information is filed in different subsections. The current subsections and their content are listed below:<p><a href='/help/sequences_section' target='_top'>More. </a></p> Sequence s (6+) i

<p>This subsection of the <a href="http://www.uniprot.org/help/sequences%5Fsection">Sequence</a> section indicates if the <a href="http://www.uniprot.org/help/canonical%5Fand%5Fisoforms">canonical sequence</a> displayed by default in the entry is complete or not.<p><a href='/help/sequence_status' target='_top'>More. </a></p> Sequence status i : Complete.

This entry describes 6 <p>This subsection of the 'Sequence' section lists the alternative protein sequences (isoforms) that can be generated from the same gene by a single or by the combination of up to four biological events (alternative promoter usage, alternative splicing, alternative initiation and ribosomal frameshifting). Additionally, this section gives relevant information on each alternative protein isoform.<p><a href='/help/alternative_products' target='_top'>More. </a></p> isoforms i produced by alternative splicing . AlignAdd to basketAdded to basket

This entry has 6 described isoforms and 3 potential isoforms that are computationally mapped.Show allAlign All

This isoform has been chosen as the <div> <p><b>What is the canonical sequence?</b><p><a href='/help/canonical_and_isoforms' target='_top'>More. </a></p> canonical i sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry.

The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows:
210-211: Missing.


צפו בסרטון: What breaks, falls apart and wears out in the Audi Multitronic CVT 01J? Subtitles. (נוֹבֶמבֶּר 2022).